Version 7.7 - Released: 04/08/2019 - Content: 107395 neurons


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Details about selected neuron
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_48082
Neuron Name :  pcs67_1
Archive Name :  Hamad
Species Name :  rat
Strain :  Long-Evans
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  0.0 day
Max Age :  1.0 day
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  neonatal
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, superficial
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  350  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 50% in z
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-10-13
Date of Upload :  2016-09-01
Persistence Vector :  pcs67_1.pvec
Note :  organotypic culture transfeted at 5 DIV and fixed at 10 DIV

Reference Article
Related Article Reference :  Type I TARPs promote dendritic growth of early postnatal neocortical pyramidal cells in organotypic cultures.

Measurements
Soma Surface :  12155.7 μm2
Number of Stems :  12
Number of Bifurcations :  46
Number of Branches :  104
Overall Width :  230.97 μm
Overall Height :  423.52 μm
Overall Depth :  10.26 μm
Average Diameter :  0.07 μm
Total Length :  3530.25 μm
Total Surface :  776.34 μm2
Total Volume :  13.59 μm3
Max Euclidean Distance :  415.56 μm
Max Path Distance :  623.22 μm
Max Branch Order :  18
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  1960
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  72.56°
Average Bifurcation Angle Remote :  69.39°
Fractal Dimension :  1.02

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